PCR是1984年開始出現(xiàn)的一項基因檢測技術(shù),由于PCR技術(shù)具有簡便易行、敏感度高等優(yōu)點,該技術(shù)被廣泛應用于基礎(chǔ)研究和臨床檢測,成為分子生物學必要的研究工具。傳統(tǒng)的PCR定量是應用終點PCR來對樣品中的模板量進行定量,通常用凝膠電泳分離,并用熒光染色來檢測PCR反應的擴增產(chǎn)物。但在PCR反應中,由于反應體系和反應條件等因素會影響PCR反應效率,甚至出現(xiàn)一些非特異性擴增產(chǎn)物。因此,用終點PCR法來定量并不準確。
熒光定量PCR是1996年推出的一種新的定量技術(shù),該技術(shù)克服了PCR法進入平臺期后定量的較大誤差問題,實現(xiàn)DNA/RNA的定量,而且具有敏感度和特異性高、能實現(xiàn)多重反應、自動化程度高、實時和準確等特點,該技術(shù)在醫(yī)學臨床檢驗及臨床醫(yī)學研究方面都有著重要的意義。
熒光定量是通過殺滅熒光源,使試劑發(fā)出熒光,從而誘導對應的dna的復制,從而檢測到dna的結(jié)構(gòu)變化,他的熒光源一般是react熒光抗體,目前在熒光定量的實驗中使用react檢測基因序列的變化。可以用來檢測轉(zhuǎn)錄組、信號通路組、外顯子組的轉(zhuǎn)錄或翻譯能力的變化等,這些轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)以及信號通路的數(shù)據(jù)將決定在熒光實驗方面的分析結(jié)果,特別是基因組dna的反轉(zhuǎn)錄活動,在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析中具有一定的重要意義。
熒光定量PCR操作的關(guān)鍵在于RNA的抽提和引物的設(shè)計。RNA的抽提需要嚴格進行RNasefree的操作,抽提的RNAOD260/OD280需嚴格控制在1.9-2.1之間。引物設(shè)計主要的考慮是其PCR反應特異性好和擴增效率高,進行PCR反應時無非特異性的條帶和引物聚合體出現(xiàn),盡量選取GC含量在40-60%的區(qū)段進行擴增。另外,還需要適應熒光定量PCR儀上機條件的設(shè)定,退火溫度在55-65°C之間。除此之外,其他各個環(huán)節(jié)如試劑的穩(wěn)定性,RNA反轉(zhuǎn)的質(zhì)量好壞,PCR上機條件的設(shè)定,加樣的手法和熟練度等等也要注意。